根据相关法律法规和搜索结果，进厂时没收手机的行为存在以下法律风险和后果：

一、法律层面的违法性

侵犯财产权

手机属于个人合法财产，公司未经法律授权擅自没收，构成对公民财产权的侵犯，可能引发侵权诉讼。

违反劳动法规定

《劳动合同法》第九条规定，用人单位不得以担保、扣押财物等方式侵犯劳动者权益。若公司因管理需要制定禁止携带手机的规定，应通过合法程序制定并告知员工，且不得直接没收。

二、可能的处理方式

警告与教育

对于初次违规员工，公司应优先采取警告、罚款或要求整改等措施，而非直接没收财物。

合同条款的约束力

若劳动合同或公司章程中明确约定了禁止携带手机，并且员工签字确认，公司可依据合同条款要求员工遵守，但需在下班时返还手机。

三、员工的维权途径

协商与投诉

员工可先与管理层协商解决，或向劳动监察部门投诉，要求公司立即返还手机并赔偿损失。

法律诉讼

若公司拒不返还手机，员工可通过诉讼主张返还财产权，并要求赔偿因没收行为造成的损失。

四、特殊注意事项

涉密岗位的特殊规定：

若员工因工作需要接触机密信息，公司可制定严格的管理制度，但需通过合法程序审批，并明确告知员工违规后果。

证据留存：建议员工保留与没收行为相关的证据（如录音、录像、书面通知等），以便在维权时使用。

综上，公司没收员工手机的行为通常缺乏法律依据，建议通过合法合规的管理手段解决问题。