根据搜索结果，iPhone 6s 最适合的系统版本需结合性能、功能需求和设备特性综合考量，具体分析如下：

一、性能与流畅度最优选择

iOS 10

- 修复了大量系统漏洞，优化了多任务处理能力，且SD Touch功能得到充分发挥。

- 对硬件资源占用更低，适合追求极致流畅体验的用户。

iOS 11.3

- 相比iOS 9，稳定性提升显著，修复了多任务卡顿、Live Photo自适应等关键问题。

- 续航表现更优，部分测试版本（如iOS 11.4 beta1）在电池续航上领先于更高版本。

二、功能与兼容性平衡选择

iOS 12

- 引入深色模式、更丰富的表情符号等新特性，系统界面更现代。

- 但部分用户反馈12及以上版本对旧机型性能有一定影响。

iOS 14

- 支持更高级的相机功能，且系统优化较好。

- 建议谨慎升级，避免因系统资源紧张导致卡顿。

三、其他注意事项

系统版本适配性：

iPhone 6s 最官方适配的系统版本为iOS 9.0和iOS 10.0，但实际体验可能因硬件老化有所下降。

实际体验差异：同一系统版本不同设备可能存在表现差异，建议通过官方渠道升级到最新稳定版本（如iOS 11.3）。

越狱设备：若设备越狱，可通过电脑升级系统；未越狱则需通过手机升级。

综上，若追求极致流畅与稳定性， iOS 10或iOS 11.3是最佳选择；若需使用新功能且能接受轻微性能损耗，可考虑 iOS 12。