双系统磁盘格式选择需根据系统版本和兼容性需求决定，以下是综合建议：

一、系统盘（C盘）推荐格式：FAT32

兼容性要求

- 需同时安装Windows XP、Win98等早期系统时，FAT32是唯一兼容的文件系统。

- 若仅需安装Windows XP及以上系统（如Win7、Win10），NTFS更优。

优势

- 兼容性好，支持旧版操作系统启动和文件读写。

- 文件传输和复制限制较少（单文件≤4GB，文件名≤255字符）。

二、其他分区（如D盘、E盘）推荐格式：NTFS

性能与安全性

- 支持大文件（最大2TB）、文件级加密和访问控制，适合存储软件、游戏等数据。

- 兼容Windows XP及以上系统，长期使用稳定性高。

适用场景

- 用于安装Win7、Win10等现代操作系统，或作为共享磁盘。

三、注意事项

安装顺序：

建议先安装XP系统（FAT32），再安装Win7（NTFS），避免使用Ghost等非官方工具。

文件互传：若需在Windows与Linux系统间传输文件，可使用工具如Ext2Fsd（仅限Windows）。

通过以上方案，既能满足多版本系统兼容需求，又能兼顾性能与数据安全性。