主分区的系统格式选择需根据操作系统类型决定，具体如下：

Windows系统

- 必须使用 NTFS格式。NTFS支持大文件管理、权限控制及磁盘配额，是Windows系统的标准分区格式。

Linux系统

- 推荐使用 ext4格式。ext4具有高安全性、快速读写性能及强大的文件系统管理能力，适合大多数Linux发行版。

旧版系统（如Windows 98）

- 可使用 FAT32格式，但存在文件大小限制（最大4GB）和安全性不足的问题，现已逐渐被淘汰。

总结：

主分区格式应与操作系统匹配，Windows用NTFS，Linux用ext4，旧版系统可用FAT32但存在局限性。