商店打发票的系统选择需根据业务需求和规模决定，以下是主要推荐方案：

一、主流发票管理系统推荐

用友畅捷通系列

- 支持快速设计发票模板、多种格式导入导出，与收银系统无缝对接，可处理增值税普通发票和专用发票。

- 具备数据统计、发票管理及统计分析功能，提升工作效率和财务管理水平。

电子发票系统（如阿里巴巴“一某通某”）

- 专为小微企业设计，支持电子发票快速开具，符合国家税务要求。

- 功能完善，可满足日常发票管理需求，操作便捷。

二、其他可选方案

税务Ukey/金税盘系统：

适用于需要开具增值税专用发票的企业，支持税务认证和数据加密。

智能开票系统：通过电子化处理实现发票全流程管理，适用于中大型企业。

三、注意事项

合规性：选择支持电子发票或税务认证的系统，确保符合国家财税政策。

易用性：优先考虑操作简单、界面友好的软件，降低培训成本。

综上，中小型超市建议选择用友畅捷通或电子发票系统，兼顾效率与合规性；大型企业可根据需求定制或采用智能开票系统。