SAP系统的缺点主要包括实施成本高、操作复杂、资源浪费及适用性不足等方面，具体可归纳如下：

实施成本高昂

- 购买、部署、定制及维护费用均较高，尤其二次开发（ABAP语言）成本显著。 - 需长期投入人力成本进行系统学习与维护，且需聘请专业顾问团队。

操作复杂且资源浪费

- 系统功能模块庞大，业务流程需跨多个页面操作，易造成资源闲置。 - 标准报表系统难以满足个性化需求，常需二次开发补充功能。

适用性不足

- 主要面向大型企业设计，中小企业的业务流程复杂度可能与其功能匹配度不高，导致“大材小用”。 - 系统刚性较强，灵活性较差，难以快速适应业务变化。

维护与技术挑战

- 系统维护复杂，后期维护成本高，且原厂现场服务支持有限。 - 需培养或雇佣专业技术人员，但顾问水平参差不齐可能影响实施效果。

建议：

中小企业应优先评估自身业务需求与资源能力，若决定采用SAP，需制定详细实施计划并控制成本，同时关注系统模块的精简与定制化开发。