在仲裁申请书中，法定代表人的职务应填写为 法定代表人或 主要负责人，具体取决于用人单位的组织架构和法律规定。以下是详细说明：

法定代表人的职务

若用人单位为法人或其他组织，法定代表人是依法代表单位行使职权的自然人，职务通常为“法定代表人”或“总经理”“董事长”等。

主要负责人的职务

若用人单位未明确法定代表人，或法定代表人因故无法履行职责时，应由 主要负责人承担法律责任。主要负责人可以是总经理、执行董事、经理等。

填写注意事项

- 两种表述均可接受，但需确保与营业执照或组织机构代码证上的登记信息一致；

- 若单位存在多个负责人，需根据实际履行职责的人员填写。

法律依据

根据《中华人民共和国仲裁法》第二十二条规定，仲裁申请书应载明当事人（包括用人单位）的姓名/名称、职务等基本信息。

示例：

申请人：张三，性别男，年龄30岁，职业工程师，工作单位：某科技有限公司，职务：总经理

被申请人：某科技有限公司，住所：北京市海淀区，法定代表人：李四，职务：董事长

通过准确填写法定代表人职务，可确保仲裁申请的合法性和有效性。