建筑工程资料中项目经理任命通知书和项目部人员设置通知书的留底归档方式如下：

一、项目经理任命通知书归档

文件组成

包含工程名称、致函单位（建设单位/监理单位）、任命人签名、项目经理资质证明（建造师执业资格证书复印件）、施工单位公章及法人代表签字等核心要素。

归档要求

- 作为工程开工前的重要文件，需与施工合同、工程招标文件等一并归档。

- 保存原件及复印件，复印件需加盖施工单位公章。

二、项目部人员设置通知书归档

文件组成

包含施工单位公章、项目经理签章、项目部人员名单（含姓名、职务、证件编号、专业分工等）。

归档要求

- 作为项目管理团队配置的证明文件，需与项目经理任命通知书同步归档。

- 保存原件及复印件，复印件需加盖施工单位公章。

三、通用注意事项

两类通知书均需在接收到后规定时间内（如7天）提交至建设单位或监理单位备案。

归档时建议使用统一格式的档案盒或文件夹，便于后续查阅。