关于手机店手机被没收的处理方式，需根据手机来源、涉案性质及法律规定综合判断，具体分为以下几种情况：

一、若手机为违法所得（如盗窃、诈骗等犯罪所得）

刑事处罚

若手机属于盗窃、诈骗等犯罪行为的直接证据，公安机关会依法追缴，并将案件移送检察机关起诉。根据《刑法》规定，盗窃数额较大者可处三年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金。

没收程序

- 证据保全：

手机作为关键证据会被扣押并送交司法机关处理。

- 法院处置：法院根据案件情况决定是否没收。若确认为违法所得，可能随案移送或单独拍卖，拍卖款上缴国库。

二、若手机为犯罪工具或被告人个人财产

犯罪工具的没收

若手机被认定为犯罪行为（如盗窃、抢劫）的直接工具，法院有权依法没收。

个人财产的区分

- 若手机为被告人合法财产且无直接关联证据，通常不会被没收。

- 但若手机在犯罪中起辅助作用（如存储犯罪工具或赃款），仍可能被没收。

三、其他情形

善意取得：

若第三方以合理价格购买手机且无过错，可能获得法律保护，手机不会被没收。

纠纷处理：若涉及个人纠纷（如债务纠纷），手机可能被作为证据保全，但所有权人可申请返还。

四、程序保障

公安机关在扣押手机时需遵循法定程序：

合法扣押：

仅对与案件有关的物品进行扣押，对合法财产应登记后退还。

证据审查：

扣押后需及时查明物品性质，与案件无关的应及时解除扣押。

建议：若涉及此类案件，建议及时联系专业律师，提供手机来源、购买凭证等材料，以便明确手机性质并维护合法权益。